以下のコードを実行すると、配列 a の添字が 3 つ表示されます。これは期待通りの動作です。

<script type="text/javascript">
var a = [ 10, 20, 30 ];
for (i in a)
	alert (i);
</script>

　ここで、prototype.js を読み込んでから、同じコードを実行すると、Array.prototype が拡張されてしまっているために、それら拡張されたメソッド名までが表示されるようになります。

<script type="text/javascript" src="http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/prototype/1.6.0.3/prototype.js"></script>
<script type="text/javascript">
var a = [ 10, 20, 30 ];
for (i in a)
	alert (i);
</script>

　以下のようにしないと最初と同じ動作になりません。

<script type="text/javascript" src="http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/prototype/1.6.0.3/prototype.js"></script>
<script type="text/javascript">
var a = [ 10, 20, 30 ];
for (i=0; i<a.length; i++)
	alert (i);
</script>

　今回はデバッガで案外と簡単に原因が特定できたのですが、これが複数ファイルに渡る巨大ライブラリだったりすると、追跡が嫌になりますね。